如果仅是单纯的包皮过长并不可怕，因为过长的包皮本身不会对健康产生什么严重的影响，包皮过长的危害在于其导致的一系列的继发性病变，其中较为常见的有以下6方面：
包皮阴茎头炎
包皮过长，清洁不够，加之包皮过长导致尿液经常积留在包皮囊内刺激包皮及阴茎头，促使其产生分泌物及表皮脱落，形成过多的包皮垢。一方面包皮垢可刺激局部包皮和黏膜发生炎症。另一方面由脱落上皮、腺体分泌物和包皮垢共同形成的温热潮湿环境一旦有细菌进入极易引发炎症。
包茎嵌顿
包皮过长的同时如果伴有包皮口狭窄，则在包皮强力翻着阴茎头上方后未能及时复位时便会形成包茎嵌顿。
尿路感染危险性增加
包皮阴茎头处的感染可以沿尿路上行引起尿路感染，包皮过长患者比正常人患尿路感染的机会高20倍以上。
患性病危险性增加
包皮过长形成的包皮与阴茎头之间的褶皱提供了病菌良好的生存环境，这是所有致病菌易潜藏的部位，梅毒、淋病等性传播疾病的病原体均能在包皮下生长并伺机进入机体导致发病。
诱发阴茎癌
反复的炎症刺激易导致阴茎鳞状上皮发生癌变，据统计90﹪以上的阴茎癌因包皮过长而起。
影响性功能
包皮过长会影响青春期的阴茎发育，成年后影响性生活质量。同时包皮阴茎头反复的炎症可导致性交疼痛，进而影响性生活。